積極化解過剩產能、優化產業結構是廣東省供給側結構性改革的一項重要任務。總體方案明確提出，嚴格執行國家投資管理規定和產業政策，嚴禁違規建設鋼鐵、水泥、平板玻璃、船舶等行業新增產能項目；加快調整優化船舶產品結構，挖掘行政執法、應急救援等領域船舶裝備需求潛力，發展項目總承包（EPC）模式，支持造船企業利用現有造船基礎設施發展海洋工程裝備、船用設備等；加強國際產能合作，帶動工程機械、電氣設備、網絡通信、海洋工程等優勢裝備產品輸出，加快廣東裝備、技術、標準、服務“走出去”步伐。

在“去降補”的行動計劃中，多項內容與船舶工業密切相關。其中，《廣東省供給側結構性改革去產能行動計劃（2016～2018年）》要求，嚴格執行國家船舶行業準入標準，從產品質量、環境保護、能耗和綜合利用、工藝和裝備、安全職業衛生和社會責任等方面，對在建、新建項目提出從業要求，加強項目的事中事后監管，配合國家公告符合條件的生產線和企業名單。《廣東省供給側結構性改革去杠桿行動計劃（2016～2018年）》提出，落實差別化信貸政策，支持、引導金融機構加大對戰略性新興產業、先進制造業、生產性服務業等重點領域的信貸支持力度。《廣東省供給側結構性改革降成本行動計劃（2016～2018年）》涉及提升企業勞動力技能水平、落實降低制造業增值稅稅負政策、降低電力等生產要素成本。今后，廣東省將支持技能晉升培訓，鼓勵企業組織員工參加技能晉升培訓并按規定給予培訓補貼；支持高技能人才培養，推動校企合作，對技工院校與產業園企業對接成效顯著的給予補貼。《廣東省供給側結構性改革補短板行動計劃（2016～2018年）》提出，加快港口公共基礎設施建設，計劃開工建設廣州港深水航道拓寬工程等23個港口航道、錨地、防波堤建設工程；重點加強珠江三角洲“三縱三橫三線”高等級航道網建設，基本形成西江干線、北江干流至珠江口港口群的高等級航運主通道。